一是药剂防治。在有病的树下，挖环状沟，用药剂灌根。在这里推荐使用高锰酸钾溶液进行灌根治疗，具体方法是将高锰酸钾用干净的水（自来水、井水、山泉水等）稀释到1500倍，每周灌根三次连续3周，对根腐病的治疗效果明显。高锰酸钾它含有植物所必需的锰和钾两种营养元素，即能消毒杀菌也能促进植物成长，可谓药肥两用。高锰酸钾使用成本低，效果明显，各地药店均有高锰酸钾销售，而且使用时对人畜安全、无毒，对作物无残留、无药害，对环境无污染。因而，高锰酸钾是一种药肥兼用，无毒、无残留、无公害蔬菜、花卉难得的杀菌剂。
二是刨根晒根。把病根刨出，使根外露，如果是根腐病导致的烂根，根腐病菌属于嫌气性病菌，通过与空气接触和利用太阳的紫外线，都能起到抑制病菌繁殖和杀灭病菌的作用。
三是注重增施有机肥。有机肥具有改良土壤，促进根系生长的作用。只要根系生命力旺盛，能不断地长出新根，烂根症状就会减轻。也可以用生物菌剂进行灌根，地衣芽孢杆菌、木霉菌、多粘类芽孢杆菌等都具有抑制病菌繁殖，促进根系生长的作用。
四是秋施基肥时，最好采用行间开沟施肥的方式。开沟能够大量切断根系，相当于对根系进行修剪。切断的根系在秋季发根高峰期会大量长出新根。这与衰老树的更新修剪的原理是相似的。
五是科学浇水。尤其是黄粘土质果园、盐碱板结土质果园，夏季下雨后或浇灌以后，很容易使土壤板结，所以在每次雨后和浇水后，都进行中耕，以疏松土壤。确实需要浇水时，应只浇行间，靠近主干部位尽量不浇水，以利土壤透气，满足根系有氧呼吸对空气的需求。
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