1.不能频繁使用
肛管和一样，都有自己特定的抗菌环境，经常使用浓度过高的高锰酸钾溶液坐浴，反而改变固有的环境，使细菌更容易侵入。
2.无炎症不使用
高锰酸钾是一种外用消毒剂，临床上常用高锰酸钾水溶液冲洗或坐浴治疗肛门、会阴等部位的炎症。如果没有炎症，就不要使用，使用高锰酸钾浓度调整偏高的时候你会发现皮肤接触过的地方都会被氧化为黄色，几日后才能恢复，可见其对皮肤和黏膜有刺激及腐蚀作用,浓度过高会灼伤皮肤,严重的会导致皮肤坏死。
3.治疗因菌群而定
只有葡萄球菌、大肠杆菌等细菌感染引起的肛管直肠周围感染，才可用高锰酸钾水溶液坐浴作为辅助治疗。因为这些病原微生物不适宜在酸性环境中生长，容易被高锰酸钾杀灭。比如霉菌性直肠炎，或霉菌性炎，它是由念珠菌引起的，用高锰酸钾水溶液坐浴不但不能抑制霉菌繁殖，还会加重病情。
4.外用时正确的操作方法
用1克高锰酸钾配5000毫升20℃~30℃温开水，同时要搅拌均匀，肉眼观察为粉红色即可使用。浸泡时间一定要达到5分钟才能细菌。
切记，配制时不可用手直接接触药品，皮肤直接接触高锰酸钾，可能被腐蚀或染色。如果不慎入眼中或灼伤皮肤，立即用大量清水冲洗，如果有维生素C溶液冲洗效果更佳。
5.现用现配
配制好的水溶液通常只能保存2小时左右，当溶液变成褐紫色时，就失去了消毒作用。最后，遇到特殊情况，如局部皮肤瘙痒、红肿等停止使用。
需要注意：高锰酸钾只能低浓度外用，切忌高浓度和口服使用，高浓度的刺激和腐蚀作用，可引起皮肤粘膜灼伤或糜烂出血。考虑到个体差异，使用之前最好向医师或药师咨询。