1、被暂停公积金提取
根据公积金管理政策的规定，如果贷款使用人出现了逾期的情况，那公积金管理中心将会暂停他的公积金提取，直到正常还贷为止。另外，如果连续出现逾期2次以上，公积金管理中心将会停止他再对公积金进行提取，而且会直接从主贷人的公积金账户中扣除钱款来补足月供，直至扣除到所有贷款还完为止。
2、被加收利息
虽然公积金贷款逾期了会被暂停提取，但是逾期并不是靠简单的暂停提取就能混过去。所以，被加收利息，也是一种惩罚手段。如果公积金贷款产生逾期了，逾期的那一部分需要根据央行的规定以合同规定中的贷款利率为基础，再加收50%罚息。如果是恶意长期逾期不还款的，银行可以按合约规定处理贷款人的抵押物，将抵押物进行拍卖，用拍卖所得来弥补公积金损失。
3、连累担保人
有些人申请公积金贷款的时候被要求提供担保人，所以如果贷款人的公积金贷款还不上了，也会连累到担保人的信贷业务，可能会导致担保人无法办理房贷、车贷信用卡、个人贷款等业务。甚至，还有可能连担保人的账户也会遭到划扣还款，用于替贷款人还贷。
4、造成不良征信记录
逾期产生后会在个人征信报告上产生不良记录。