1985年，宁安辖宁安、渤海、东京城、石岩、海浪、沙兰6个镇;范家(已撤销)、江东(已撤销)、江南、宁西(已撤销)、兰岗、平安(已撤销)、卧龙、城东(已撤销)、马河、杏山(已撤销)、兴华(已撤销)、三陵、镜泊13个乡，332个村委会，8个街边办事处，48个居民委员会。
1993年5月，经国务院批准，撤销宁安县建立宁安市(县级)。
2001年1月，根据国务院和黑龙江省政府指示精神，进行了乡(镇)合并，将原来的宁安镇范家乡合并为宁安镇;将原来的江南满族、朝鲜族乡和江东乡合并为江南满族、朝鲜族乡;将海浪镇和宁西乡合并为海浪镇;将东京城镇和城东朝鲜族、满族乡合并为东京城镇;将石岩镇和平安乡合并为石岩镇;将三陵乡和兴华乡合并为三陵乡;将渤海镇和杏山乡合并为渤海镇;保留兰岗镇、卧龙朝鲜族乡、马河乡、镜泊乡。
2014年，宁安市共辖宁安镇、东京城镇、渤海镇、石岩镇、海浪镇、沙兰镇、兰岗镇等7个镇，江南乡、马河乡、三陵乡、卧龙乡、镜泊乡等5个乡，240个行政村，1个市辖城区街道办事处、2个镇辖街道办事处、11个社区居委会。