2000年，南丹县辖8个镇、2个乡、3个民族乡。
2003年南丹县行政区划一览(7个镇、2个乡、3个民族乡:城关镇、大厂镇、车河镇、芒场镇、六寨镇、月里镇、吾隘镇、罗富乡、巴定乡、中堡苗族乡、八圩瑶族乡、里湖瑶族乡)(根据当年广西行政区划代码整理)
城关镇 辖:城南、城北、莲城、铜江、拉所、小场、车马、拉要8个社区;四山、茅坪、莲花、火幕、鸳鸯桥、拉易、恩村、关上、大平、挽白、更垌、中坪12个行政村。
大厂镇 辖:铜坑、长坡、巴力、铜车江4个社区;官山、翁乐、杨州、南胃、龙更、龙藏、大厂7个行政村。
车河镇 辖:车河、拉么2个社区;车河、八步、坡前、拉么、堂汉、骆马、大平7个行政村。
芒场镇 辖:芒场社区;拉麻、磨岩、尧林、坡鸾、蛮降、拉希、拉腊、拉者、巴平、幕麻、者麻、蛮坝12个行政村。
六寨镇 辖:六寨社区;者远、甲棉、龙马、银寨、壮里、雅陇、麻阳、弄撒、播细、拉堡、松柏、化里12个行政村。
月里镇 辖:月里社区;上稿、巴峨、播闹、化良、摆者、纳弄、立外、纳塘、牙林9个行政村。
吾隘镇 辖:江河社区;吾隘、塘谋、独田、纳定、思河、凡里、昌里、那地、纳弯、德竹、古兰、同贡12个行政村。
罗富乡 辖:罗富社区;玉兰、六内、坡旁、塘丁、雍里、纳老、打更、巴良、板劳、罗更、央哨、黄黑、黄江、杏村、湾村、龙腊、罗屯17个行政村。
巴定乡 辖:巴定社区;蛮卷、陋里、才怀、龙腰、帮里5个行政村。
中堡苗族乡 辖:中堡社区;九立、懂托、拉纳、大水井、东井5个行政村。
八圩瑶族乡 辖:八圩社区;拉友、七圩、砂厂、下坪、立坳、汉度、朝房、文家、利乐、甲坪、老圩场、瑶寨、塘浪、关西、吧哈15个行政村。
里湖瑶族乡 辖:里湖社区;瑶里、怀里、纪兰、岜地、纪杏、甲木、八雅、贵江、仁广、纪后、懂甲、化果12个行政村。
2005年，巴定乡并入六寨镇。