1987年12月23日，国务院批准（国函185号）：将巴马瑶族自治县的板兰乡全部，东山、凤凰、羌圩三个乡的十七个村划归大化瑶族自治县。广西壮族自治区办公厅1988年3月30日《关于大化瑶族自治县行政区域范围的补充通知》确定的行政区域：巴马瑶族自治县的板兰乡全部，凤凰乡的那色、京屯、巴、追、巴岩等4村，东山乡的弄冠村，羌圩乡的羌圩、坡马、艾圩、洪筹、那良、古龙、东杠、健康等8村，乙圩乡的乙圩、常吉、常怀、果好等4村划归大化瑶族自治县。
2000年，巴马瑶族自治县辖1个镇、11个乡：巴马镇、燕洞乡、甲篆乡、那社乡、所略乡、局桑乡、西山乡、平洞乡、东山乡、凤凰乡、那桃乡、百林乡。 根据第五次人口普查数据：全县总人口218724人，其中各乡镇人口（人）： 巴马镇 56034、 燕洞乡 21665、 甲篆乡 19778 、那社乡 13764 、所略乡 22333 、局桑乡 8715 、西山乡 10473、 平洞乡 7517 、东山乡 9470 、凤凰乡 8681、 百林乡 14377、 那桃乡 25917。现在有彝族、白族、傣族、壮族、苗族、回族、傈僳族、拉祜族、佤族、纳西族、瑶族、藏族、景颇族、布朗族、布依族、阿昌族、哈尼族、锡伯族、普米族、蒙古族、怒族、基诺族、德昂族、水族、满族、独龙族等民族分布。
2003年巴马瑶族自治县行政区划一览（1个镇、11个乡：巴马镇、燕洞乡、甲篆乡、那社乡、所略乡、局桑乡、西山乡、平洞乡、东山乡、凤凰乡、百林乡、那桃乡）（根据当年广西行政区划代码整理）
100 巴马镇 辖：城东、城中、城南、城北4个居委会；巴马、巴发、巴廖、设长、盘阳、法福、练乡、坡腾、巴定、赐福、那坝、龙洪、介莫、元吉14个行政村。