县境内受北东向断裂带（泉州—汕头断裂带和滨海断裂带）控制

县境内受北东向断裂带（泉州—汕头断裂带和滨海断裂带）控制，同时又受北西向断裂带（上杭—诏安断裂带）及其活动构造断裂的影响，形成山区地段和沿海地段。河流大多呈格子状水系网型式，大部分河流循北西及北东向断裂发育。

根据华东地区学术讨论会研究表明，台湾海峡在第四纪期间，曾有数次上升为陆地，使大陆与台湾直接连成一片，在上升为陆地的最后一次是1.1万年前，海水急剧退却，低于海平面50米以下，使台湾海峡形成广阔的海滨冲积平原。新中国成立后，诏安、东山及广东南澳等5个县渔民在兄弟屿、南澎列岛、七星礁附近海域中（距海岸十至几十公里，水深30～50米），打捞到大量房屋墙体的灰段、地板块、砖块、瓦片及生活用品，还有鹿、熊骨骼。邻区深沪湾海底，1986年发现有8000年前的陆生古森林（包括古油杉）。台湾屏东县万山与东山县均发现与8000年前制作方法及风格相似的古岩画，证明粤东、闽南沿海人类史上曾是一块沉没的大陆。