木里义务教育阶段学校32所，其中九年制学校6所，普通小学26所，教学点89个，共有在校小学生12493名，小学正常适龄儿童入学率100%。中学9所，其中完全中学1所，初级中学2所，九年一贯制学校5所，独立设置的少数民族九年一贯制学校1所，县内初中学生4922人，县外就读350人左右，初中阶段入学率98.79%。2016年秋季学期，县内普通高中在校生普通高中学校1所，县内就读高中生1623人，县外就读约（包括“9+3”、普通高中、其它中职）2535人，16—18周岁少年6026人，高中阶段入学率69%。深入各学校开展藏区“9+3”政策优惠宣传，分段指导考生填报志愿，努力做到应读尽读，确保每一个学生都有学上。2016年招生578人，实际录取551人。
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