截至2016年2月，山南市下辖1个市辖区（乃东区），11个县（扎囊县、贡嘎县、桑日县、琼结县、曲松县、措美县、洛扎县、加查县、隆子县、错那县、浪卡子县），24个镇，56个乡，596个行政村。市政府驻乃东区。
| 行政区 | 面积 （平方千米） | 政府驻地 |
|---|
| 乃东区 | 2211 | 泽当镇 |
| 扎囊县 | 2157 | 扎塘镇 |
贡嘎县 | 2283 | 吉雄镇 |
| 桑日县 | 2634 | 桑日镇 |
| 琼结县 | 1030 | 琼结镇 |
| 曲松县 | 1936 | 曲松镇 |
| 措美县 | 4530 | 措美镇 |
| 洛扎县 | 5570 | 洛扎镇 |
| 加查县 | 4493 | 安绕镇 |
| 隆子县 | 9809 | 隆子镇 |
| 错那县 | 34937 | 错那镇 |
| 浪卡子县 | 8109 | 浪卡子镇 |
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