丽江市境内河流分属两大流域、三大水系

  丽江市境内河流分属两大流域、三大水系，即长江流域的金沙江水系和雅砻江水系、澜沧江流域的黑惠江水系。其中，长江流域面积20799平方公里，占总面积的98%；澜沧江流域面积420平方公里，占总面积的2%。全市共有金沙江、雅砻江、澜沧江的二级及其以上支流93条，其中，流域面积在200平方公里及其以上的河流有21条。^[1] 

  境内有泸沽湖、程海及拉市海3个天然湖泊。程海位于永胜县中部的程海镇，属内陆断陷型偏碱性深水湖泊。流域面积318.3平方公里，东西宽3.5公里，南北长20公里。1981年年平均水位1518.26米，相对水面面积77平方公里。