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优质的蛋白shotgun服务

关键词:

蛋白组DIA

2019-02-01

中科新生命自成立起一直专注蛋白shotgun、短链脂肪酸等产品生产,公司拥有多条生物信息学、蛋白质组学生产线,目前已成为蛋白质定性行业整套解决方案服务商。

蛋白质定性产品基本资料如下: 产品名称:蛋白质组分析; 品牌商标:中科新生命; 价格:1; 售后服务:优质;蛋白质化x7b837n产品详细说明:1.对生物样本而言,每进行一次分析就是一次样本损耗,并且即使是低温条件,长时间保存也会造成信息改变。因此,生物样本算是一种资源。该研究基于一种全新的质谱技术蛋白组DIA——Data-IndependentAcquisition(DIA),为我们带了一种能够将生物样本中的大量蛋白质信息高效地转化数字信息的方法,以实现蛋白信息的保留和分析。该方法体系由样本制备和质谱数据采集两个主要步骤组成。样本制备采用的是pressurecyclingtechnology(PCT)法。简单来说,PCT法就是通过程序性地对样本施加超高压力,实现蛋白质和基质的解离。其优点是,在提高提取效果的同时,减少化学试剂、高温对样本的影响。在常规PCT方法上,研究者进行了进一步地优化,使其更适用于蛋白质组样本的提取,并且在整个过程中尽可能实现各提取步骤的无缝对接,以减少样本转移过程,实现尽可能高的平行性。方法评价结果表明:每百万细胞能够获得116ug肽段,每mg肾脏组织能够获得50ug肽段,其得率比传统方法提高40%;并且技术重复的CV<;8%。传统的蛋白质组质谱分析技术,如大家了解的shotgun、labelfree、iTRAQ/TMT等,是无法实现该目的的。因为,传统的蛋白组DIA技术在数据采集过程中存在较高的数据丢失和采集的随机性。简单来说,传统方法采用了一种叫做DDA(data-dependentacquisition)的采集方式。在这个采集过程中,每个扫描周期内,质谱只对丰度的几个信号(一级质谱)进行二级信号采集(二级质谱),其余信号的二级信号则丢失了(如果没有二级信号,就无法知道这个信号是什么蛋白质,也就没有意义了)。


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